หลังจากใช้งานประจำวัน ต้องวางชุดจั๊มสูทไว้ในตู้เก็บของที่สะอาดที่กำหนด ต้องไม่สัมผัสกับพื้นหรือวางบนชั้นล่างสุดของตู้ แต่ควรแขวนให้เรียบร้อย
พื้นที่จัดเก็บจะต้องแห้งและสะอาด ควรทำความสะอาดพื้นที่ล่วงหน้าเพื่อป้องกันไม่ให้ฝุ่นจากสิ่งแวดล้อมปนเปื้อนเสื้อผ้า
หมวกคลุมรองเท้าและที่คลุมรองเท้าที่เข้ากันอาจจัดเก็บไว้ร่วมกับชุดจั๊มสูทได้ หากจำเป็นสามารถใส่ในถุงสะอาดที่ปิดสนิทก่อนใส่ลงในตู้เพื่อแยกออกจากการปนเปื้อนเพิ่มเติม
บุคคลที่ได้รับมอบหมายควรจัดการชุดจั๊มสูทที่เก็บไว้และเก็บรักษาบันทึกการจัดเก็บและรายละเอียดการออก ชุดจั๊มสูทใดๆ ที่พบว่ามีการปนเปื้อนหรือเสียหายจะต้องถอดออกจากพื้นที่จัดเก็บทันทีเพื่อการประเมินและการจัดการในภายหลัง
สำหรับสภาพแวดล้อมที่มีความสะอาดสูง- ชุดจั๊มสูทอาจจัดเก็บไว้ในตู้ทำความสะอาดพิเศษซึ่งมีระบบหมุนเวียนอากาศที่สะอาด พร้อมการฆ่าเชื้อด้วยรังสียูวีเป็นระยะๆ เพื่อรักษาความสะอาดระหว่างการเก็บรักษา

